Los fitoflagelados, también llamados fitomastiginos o fitomastigóforos, son una subclase de protozoos flagelados, de la clase de los flagelados, con caracteres de vegetal, ya que poseen membrana celulósica y cromatóforos con clorofila, gracias a lo cual pueden sintetizar materia orgánica a expensas de las substancias minerales.
Muchos de ellos forman colonias, con diferenciación entre los individuos que las integran.
Comprende los órdenes de los crisomonadinos, criptomonadinos, fitomonadinos, eugleninos y dinomonadinos.